מבדיקות ראשוניות שבוצעו לאחר גילוי אלפי דגים מתים בנחל לכיש עולה, שהגורם המיידי למותם היה כנראה היעדר חמצן במים. בכמה נקודות שנבדקו שיעורי החמצן היו אפסיים ממש. לכן ניתן היה להבחין בדגים (רוב הדגים בנחל הם דגי בורי) ששרדו כשהם שוחים בגובה פני המים ומוציאים את פניהם בניסיון לנשום.
הדבר עשוי לרמז על חדירה של חומר אורגני בריכוז גבוה לנחל. יש כמה נסיבות שיכולולת להביא לירידה דראסטית בחמצן במים ואחת מהן היא חדירה של ביוב למערכת הניקוז במהלך ירידת הגשם ביום שני – ודרכו אל הנחל. אבל זו רק אפשרות אחת.
האירוע ממחיש עד כמה המאזן האקולוגי של הנחל רגיש ושביר. קטע הנחל הרטוב הוא מעין שלולית אחת גדולה, צרה וארוכה ובעיקר סגורה, במשך רוב ימות השנה. כל שינוי עשוי להיות דרמטי.
היורה שירד בתחילת השבוע היה די חזק (11 מ"מ באשדוד), אבל לא חזק דיו כדי לגרום לנחל לפרוץ את דרכו אל הים. לכן השינויים שנגרמו במי הנחל – ועדיין לא ברור לגמרי מה טיבם – נשארו בתוכו ולא נמהלו, עד שטרקטורים פתחו את סכר החול הטבעי והמים גלשו לים.