במהלך הלילה הרסו כוחות צה"ל בשיתוף לוחמי משמר הגבול והמנהל האזרחי את בתיהם של שני המחבלים, אסאמה עטא ובראא צאלח שביצעו את הפיגוע המשולב בירושלים שבו נרצחה לוחמת מג"ב הדס מלכא מגבעת עזר שלעד אשדוד. בנוסף אטמו את בית המחבל השלישי עאדל ענכוש שבדיר אבו משעל.
גם ביתו של המחבל מאלכ חאמד שבסילוואד שביצע את פיגוע הדריסה בצומת עפרה ב-6 באפריל, שבו נרצח חייל צה"ל סמל אלחי טהרלב – נהרס.
בחקירות שבוצעו לאחר הפיגוע בירושלים נחשף כי המחבלים, אסאמה עטא, בראא צלאח ועאדל ענכוש שבדיר אבו משעל – נכנסו לירושלים יום טרם הפיגוע, בהסעה מאורגנת של עשרות תושבי הגדה ללא אישורי כניסה לישראל. נגד נהג ההסעה הוגש לבית המשפט השלום בירושלים כתב אישום בגין גרם מוות ברשלנות והסעת שב"ח בנסיבות מחמירות.